程千帆教授對文史的研究是契而不舍的，對自己的學生也是循循善誘的，然而他對不平的世事卻是從不客氣的。還是在1944年，金陵大學發生學校教會負責人貪污教師平價米事件。程千帆夫婦告發此事反受不公正處理，一氣之下，寫了四首《鷓鵠天》以記錄這件事。其中第一首云：

　　百尺高樓數仞墻， 蠻弦羯鼓度新腔。

　　暗收香稻防鸚鵡， 故聽孤桐惱鳳凰。

　　春漏泄，意愴皇。 記名瑤冊忍相忘。

　　何曾一斗供閑醉， 空自殷勤捧玉觴。

　　詞中對當局見利忘義、中飽私囊和欺騙教師、扼殺正義的行徑可謂義憤填膺，深惡痛絕!

　　就是因為這種剛直不阿的性格，程千帆教授在1957反右派政治運動中，受到了不公正的處理。首先是撤銷了教授職稱和中文系主任職務，離開了工作二十多年的講臺和和諧相處的學生，到學校資料室抄了幾年的卡片。后來到學校建筑工地參加勞動。再后來到八里湖、沙洋等地參加體力勞動，一連多年不能回家。夫人沈祖芬在思念中寫詩云：

　　歷盡新婚成老別，

　　未成白首碧山期。

　　在如此艱辛的逆境中，程千帆始終執著地熱愛自己的文史研究。在穿著襪子下污泥溝做事的時候，他一面鏟污泥，一面思索著《宋詩選》一書的修改；在沒有水洗澡的沙洋農場里，他思索著自己還能讀書、還能想問題，所做地工作是對人民有用的，將來總有一天還會用得著；在摘了帽子留在五七干校的時候，他抓緊時間，校王安石的詩，批注《杜詩鏡詮》；在文稿失而復得時，他一個字一個字地抄寫，一本厚厚的《史通箋記》，硬是工工整整地抄了兩遍……

　　這種精神的壓抑和體力的透支，竟然持續了一十八年!程千帆由年富有力強的不惑之年，變成了白發蒼蒼的花甲老者。這是何等漫長的歲月呀!這是何等漫長的等待呀!

　　此情可待成追憶，

　　只是當時已惘然。

　　就是懷著有些惘然和不懈追求交織在一起的心境，程千帆教授終于回到了武漢大學。

　　正當他的精神有所輕松的時候，夫人沈祖芬突遇車禍離世。程千帆的心又痛得流血了。沈祖芬教授為了愛情，跟著程千帆受了很多苦；程千帆教授為了愛情，在沈祖芬身后默默地整理她的學術著作和小說。后來，沈教授的著作出版了，小說則收進了冰心、柯靈主編的小說集中，程千帆教授以此視為永遠的紀念。

　　此后有一段不太長的時間，程千帆教授住在一棟修建長江大橋時的司機房里，重新拿起了著書立說的筆。